Oktubre 2012: Ang "Junk DNA" ay hindi basura

Ang DNA ay ang pagpapaikli para sa deoxyribonucleic acid na nakaayos sa mga chromatins, kung saan ang DNA ay istrakturang naiipon ng mga protina. Nagdadala ang DNA ng impormasyong genetiko ng lahat ng mga kilalang buhay na organismo kabilang ang mga tao. Ang daloy ng impormasyong genetiko ay ang DNA ay nai-transcript sa RNA (transcription) na hinihimok ng mga salik na salin at pagkatapos ay isinalin sa mga protina (pagsasalin), na maaaring mga hormon, mga enzyme, sangkap ng istruktura ng mga cell, atbp. Bumalik noong 2003, ang National Human Genome Inilunsad ng Research Institute ang proyekto na ECODE (Encyclopedia of DNA E Element), na isang kasunduan sa pagsasaliksik sa publiko. Ang layunin ng proyektong ito ay upang maunawaan ang mga elemento ng pagganap sa genome ng tao. Ang isang piloto na pag-aaral mula sa proyekto ng ENCODE na kinilala at nailalarawan sa 1% ng genome ng tao. Sa tagumpay ng pag-aaral ng piloto, ang proyekto ng ENCODE ay pinataas upang pag-aralan ang buong genome ng tao.

Ang "Junk DNA" ay mga bahagi ng isang pagkakasunud-sunod ng genome na kung saan walang makikitang pagpapaandar ang natukoy. Gayunpaman, noong nakaraang linggo dumalo ako sa isang club ng journal ng immunology at nalaman na ang "junk DNA" ay hindi walang silbi. Ang artikulong ipinakita ay inilathala ng Kalikasan (Proyekto ng ENCODE), na nagsiwalat ng mga di-coding na rehiyon ng transaksyon ng gene na kontrol ng DNA tulad ng switch na "ON / OFF" sa mga gen. Una nang nai-mapa ng mga may-akda ang mga site na pinaka-sensitibo na mai-cleave ng isang enzyme na tinatawag na DNase I. Ang mga DNase I hypersensitive sites (DHS) na ito ay naiugnay sa kung saan ang mga kadahilanan kung saan ang pagbubuklod ng regulasyon ay magbubuklod. Pagkatapos, ipinakita nila na ang DHS na ito ay matatagpuan malayo sa mga rehiyon ng pag-coding. Sa halip na ang dogma na ang pag-access ng chromatin at DNA methylation ay nakakontrol sa kakayahang mai-access ang mga salik ng salin, iminungkahi ng mga may-akda na ang mga kadahilanan ng transcription ay humimok ng kakayahang ma-access ang chromatin, na kung saan ay baligtad na naiugnay sa DNA methylation. Pagkatapos ng lahat, ang papel na ito ay nagbigay ng mga bagong pananaw tungkol sa mga hindi pang-coding na rehiyon ng genome ng tao, na kinilala ang mga ito bilang mga rehiyon ng pagkontrol.

Ang proyekto ng ENCODE ay maaaring mapabilis ang pag-unawa sa mga proseso ng biological at estado ng sakit sa pamamagitan ng pagbibigay ng mga pananaw sa kung paano nakikipag-ugnay ang mga protina sa DNA upang makontrol ang pagpapahayag ng gene. Sa palagay ko ang proyektong ito ay malayo pa ang lalakarin dahil ito ay lamang ang dulo ng iceberg. Sa palagay ko ang genome ng tao ay may higit pa upang maipakita at ang mga siyentista sa buong mundo ay nagsisimulang tuklasin at ibunyag ang pagpapaandar ng iba't ibang mga rehiyon ng genome ng tao.

Sanggunian: Kalikasan 2012 489 (7414): 75-82

Ni Vicki Cheng