Octobre 2012: «Junk DNA» n'est pas indésirable

L'ADN est l'abréviation de l'acide désoxyribonucléique qui est organisé en chromatines, dans lequel l'ADN est structurellement compacté par des protéines. L'ADN contient des informations génétiques sur tous les organismes vivants connus, y compris les humains. Le flux d'informations génétiques est que l'ADN est transcrit en ARN (transcription) entraîné par des facteurs de transcription, puis traduit en protéines (traduction), qui peuvent être des hormones, des enzymes, des composants structurels de cellules, etc. En 2003, le National Human Genome L'Institut de recherche a lancé le projet ECODE (Encyclopedia of DNA Elements), qui est un consortium de recherche public. Le but de ce projet est de comprendre les éléments fonctionnels du génome humain. Une étude pilote du projet ENCODE a identifié et caractérisé 1% du génome humain. Avec le succès de l'étude pilote, le projet ENCODE a été étendu pour analyser l'ensemble du génome humain.

«ADN indésirable» sont des parties d'une séquence génomique pour lesquelles aucune fonction discernable n'a été identifiée. Pourtant, la semaine dernière, j'ai assisté à un club de lecture d'immunologie et j'ai appris que «l'ADN indésirable» n'est pas inutile. L'article présenté a été publié par Nature (Projet ENCODE), qui a révélé ces régions non codantes de la transcription des gènes de contrôle de l'ADN comme le commutateur «ON / OFF» vers les gènes. Les auteurs ont d'abord cartographié les sites les plus sensibles à être clivés par une enzyme appelée DNase I. Ces sites hypersensibles à la DNase I (DHS) sont en corrélation avec les facteurs auxquels la transcription de régulation se lierait. Ensuite, ils ont démontré que ces DHS sont situés loin des régions codantes. Au lieu du dogme selon lequel l'accessibilité de la chromatine et la méthylation de l'ADN contrôlent l'accessibilité des facteurs de transcription, les auteurs ont suggéré que les facteurs de transcription conduisent à l'accessibilité de la chromatine, qui est inversement corrélée à la méthylation de l'ADN. Après tout, cet article a fourni de nouvelles informations sur les régions non codantes du génome humain, qui les ont identifiées comme étant des régions régulatrices.

Le projet ENCODE peut faciliter la compréhension des processus biologiques et des états pathologiques en fournissant des informations sur la manière dont les protéines interagissent avec l'ADN pour réguler l'expression des gènes. Je pense que ce projet a un long chemin à parcourir car ce n'est que la pointe de l'iceberg. Je pense que le génome humain a beaucoup plus à découvrir et que les scientifiques du monde entier commencent à découvrir et à révéler la fonction des différentes régions du génome humain.

Référence: Nature 2012 (489): 7414-75

Par Vicki Cheng